Un equip militar d’elit (SG-1) ha de tornar a la Terra quan dos dels membres del seu equip desapareixen misteriosament. Tornen a un món on Stargate -una antiga porta estel·lar que els transportava a centenars de planetes- encara no ha estat descoberta i les seves vides han estat esborrades. Aquesta vegada, hauran de convèncer a un govern i a tot un exèrcit que el temps ha estat alterat per un potent enemic alienígena (Ba’al) per poder conquerir la Terra mentre lluiten contrarellotge.