L’Scooby-Doo i companyia són al Japó amb la Daphne, que competeix al gran campionat d’arts marcials. Aviat, però, la colla de la Màquina del Misteri coneixeran la llegenda de l’espasa del destí i del samurai negre, el senyor de la guerra més temible de la història del Japó. Resulta que el pergamí del destí conté l’única pista sobre el lloc secret on hi ha l’espasa maleïda. Si el fantasma del samurai negre és capaç de resoldre l’endevinalla del pergamí abans que els nostres herois, reclamarà l’espasa i alliberarà el seu esperit malèfic. Un nou misteri per al gos més poruc, més còmic i més efectiu que has conegut mai! Te’l perdràs?!