Les boles perdudes són uns objectes amb un gran poder que, reunides, poden deslligar el caos al món. Dues bandes rivals cerquen fer-se amb el control de les boles. Els primers volen invocar al Maligne i els segons pretenen evitar que el mal s’estengui pertot arreu. Una casualitat fa que una de les boles arribi a les mans d’en Shin Chan.