Han passat quatre anys des que els agents J i K, els Homes de Negre buscadors d’alienígenes, van evitar un desastre intergalàctic, i des d’aleshores, K ha tornat a la comoditat de la seva vida civil, mentre que J continua la seva feina controlant els extraterrestres. Ara, davant una greu amenaça, J haurà de convèncer K perquè torni als Homes de Negre i l’ajudi a salvar la Terra.