Dos adolescents apareixen “morts” en un magatzem abandonat amb tres puncions al paladar tou, marca dels transmutadors de la dimensió alternativa. L’equip Fringe analitza les proves, així com els motius del cervell del grup, Thomas Jerome Newton. Després de descobrir un embrió transmutador, Walter torna al laboratori per fer més proves, mentre Olivia i Peter busquen respostes a Massive Dynamic. Mentrestant, Peter confessa un secret de família a l’Olivia i Walter s’esprem el cervell per recordar què sap Newton sobre la “construcció d’una porta”.