Al cap de 40 anys, la tinent Ripley, única supervivent de la nau “Nostromo”, es recollida de la seva càpsula de salvament i deshivernada. Durant tot aquest temps el planeta d’on va sortir l’Alien, el LV-426, és colonitzat però s’ha perdut tota comunicació amb els seus habitants. Per investigar el succeït s’envia un equip de marines espacials, amb Ripley al capdavant de l’expedició. El que els espera allà no és només una criatura, en són milers….
Quan la nau comercial Nostromo, de retorn a la Terra, intercepta una senyal d’auxili procedent d’un planeta proper, els set tripulants són despertats del seu estat d’hibernació per a investigar el seu origen. Després d’un mal aterratge sobre el planeta, alguns membres de la tripulació deixen la nau per a explorar l’àrea. Al mateix temps descobreixen la colònia oculta d’una estranya criatura amagada en les restes d’una nau. Un darrere l’altre, els tripulants seran víctimes de la terrible bèstia de matar que han pujar a bord.