Ja fa cent anys que la Federació va visitar per darrer cop el planeta Sigma Iota 2. Ara és el torn de l’Enterprise de fer la visita de rigor, trobant-se com ha canviat la societat.
Un lladre de poca monta, en Rocky Valentine, és ferit durant un robatori. Rep la visita del polit Senyor Pip que el transporta a una realitat on no ha comés errades.
Degut a un abocament químic incontrolat al riu Han, de Seul, un peix muta fins a extrems increïbles convertint-se en una bèstia enorme que terroritza la població. Algunes de les seves víctimes se les emporta a un lloc desconegut.
Fa uns anys un ous de dragons de Komodo arribaren a la costa d’una illa de Carolina del Nord. D’alguna manera les cries varen sobreviure i passats vint anys la colònia ha crescut, s’han adaptat i ara controlen l’illa. Un jove ha perdut els seus pares atacats pels rèptils, però no els ha vist, deixant-lo traumatitzat.
L’Enterprise és en camí cap a l’estació espacial 6 per a que la tripulació reposi, quan la tinent Uhura rep un missatge a trossos en el que entén les coordinades d’un sector i el nom de la U.S.S. Intrepid, una nau tripulada només per vulcanians.
Cercant una font sulfurosa per tal d’obtenir sofre i poder fabricar pòlvora, el professor Challenger, en Malone i la Verònica són capturats per uns nadius.
En aquesta ocasió el grup de viatgers arriba a un poble molt pacífic; tant que no hi ha ni sheriff. Només hi destaquem un antic pistoler amargat que es passa el dia begut.
La tripulació rep una crida d’auxili des d’una petita nau i teletransporta el seu únic ocupant dins la Voyager. Resulta ser una femella vidiana, seriosament malalta de la fàgia i que està agonitzant.
Els pistolers Roxanne i Trent, capturats temps enrera per la Wilma, planegen una venjança enverinant la Terra amb gas nerviós del S.XX. En Buck i la Wilma hauran de destruir el gas, que es troba en un amagatall situat a un cinturó d’asteroides. Però descobriran que l’única persona capaç de navegar a través del cinturó és un vell pilot retirat de l’antic Esquadró 69.
Degut a l’aterratge accidentat d’un coet a Mart, l’únic supervivent és un científic. Ara ha d’enfrontar-se als habitants nadius.
Fa onze anys la nau Farragut es va trobar amb una criatura mortal en forma de núvol, amb tendències vampíriques. En aquell temps un jove tinent Kirk era a bord de la nau, i la criatura va matar el seu capità i la meitat de la tripulació. Ara l’Enterprise es troba amb el mateix núvol.
Som a l’any 2346. La ciutat de Yokohama està administrada per l’alcalde Woo que ha imposat una llei prohibint el se*e, matrimoni i vincles familiars entre parelles heterose*uals. Per tal de fer que es compleixi, administra obligatòriament entre la població una droga. Però no tothom hi és conforme i un grup de dissidents s’hi enfronta.
El professor Summerlee és atacat per una abella gegant que li injecta el seu verí. Aquest és mortal i la Verònica recomana visitar una remeiera per tal d’intentar guarir-lo.
En recerca d’en Vash, la Meryl i la Milly arriben a una ciutat deserta. El troben i els hi explica que ara està exercint de guardaespatlles.
Durant un intent per teletransportar a bord un tros d’un cometa, inadvertidament porten dins la nau un membre del Continuum Q que va ser empresonat dins el cometa. El Q fugitiu desitja expressar el seu agraïment i vol fer-li un regal a la tripulació.
Els membres de la Legió de la Mort descobreixen la mascarada d’en Buck, però aquest encara els convenç de que està de part seva. Decideixen seguir endavant amb el pla.
Durant una missió rutinària cap a un planeta, en Kirk, Uhura i Chekov són interceptats i abduïts per un poderós i distant raig transportador. Arriben a un planeta anomenat Triskelion on són immediatament atacats per èssers de diverses espècies.
En un pacífic carrer d’una població qualsevol comencen a passar estranys fenòmens, i gent misteriosa desperta la paranoia dels habitants.
Ofereixen 60 bilions de doble dòlars per la captura d’en Vash l’Estampida, i això fa que apareguin tota mena de caçadors de recompenses disposats a fer el que sigui per tal d’aconseguir-los.
Una colla de veterans del Vietnam inadaptats utilitzen un vell bombarder B-29, l’Uncle Slam, per a emetre el seu canal de televisió pirata: SM TV. Mai no baixen a terra i es dediquen a boicotejar els polítics que no els agraden.
Fugint d’un tiranosaure rex, els expedicionaris són capturats per uns éssers rèptils molt semblants als humans, en un estadi evolutiu equivalent al de l’antiga Roma.
New Chicago està en perill de ser destruida per la Legió de la Mort, un grup d’assassins interestel·lars que volen destruir el reactor matèria-antimatèria per venjar la mort d’un dels seus membres a mans d’un agent del Directori de Defensa. En Buck intentarà evitar la destrucció fent-se passar per un dels seus membres i infiltrant-se dins del grup.
El capità Kirk lidera una missió en un planeta primitiu i pacífic, que ja va visitar mentre era tinent, tretze anys abans. Es troben emboscats per un grup de nadius amb armes molt per damunt del seu estadi evolutiu, i el Sr. Spock resulta ferit.
Els expedicionaris intenten agafar el màxim nombre de proves possibles per tal de fer-les valdre quan tornin a la civilització. Però no triguen en donar-se compte de que aquesta no serà una tasca tan fàcil.
En Buck i l’agent Marla Landers del Directori de Defensa viatgen a Sineloa, una ciutat del joc que a Buck Rogers li recorda Las Vegas de la Terra. La seva missió és localitzar i retornar a la Terra una noia segrestada pel dirigent de la ciutat, en Velosi, que vol extraure informació de la ment de la noia per derrotar a un dels seus contrincants, l’Armat.
La tripulació segueix una arma de disseny cardassià capaç de fer una destrucció massiva. Mentre van servir al Maquis, en Chakotay i na Torres van trobar-se amb aquest mateix míssil, anomenat “Cuirassat”, en el quadrant Alpha i Torres el va reprogramar per tal que ataqués els propis llançadors.
L’Enterprise és assignada per transportar embaixadors de diversos mons a la conferència de Babel. Entre ells es troben l’ambaixador Sarek, de Vulcà, i la seva esposa Amanda, els pares d’Spock. Mantenir la pau a bord és complicat i un dels ambaixadors resulta assassinat.
En Buck no vol integrar-se a la junta de defensa, però hi col·labora ensenyant les estratègies de la seva època. Mentrestant es detecta una malaltia deguda al menjar contaminat que està afectant a molta gent i fa estralls amb els pilots.
A enginyeria es troba el cadàver d’un tripulant i tothom creu que es tracta d’un accident, fins que el Doctor determina que ha estat realment un assassinat. La investigació conclou que ha estat un maquis, en Sudar, el causant del crim. El motiu? “No m’agradava la manera com em mirava”.
A l’any 3000 la humanitat és esclava d’una raça extraterrestre. Davant el seu extermini proper, uns pocs es rebel·len contra l’opressor.