Cheesebridge (Pont de Formatge) és una elegant ciutat de l’era postvictoriana, obsessionada pels diners, la classe i el més deliciós dels formatges pudents. A sota dels seus encantadors carrers empedrats hi viuen els Boxtrolls, uns monstres que a la nit surten de les clavegueres per aconseguir els béns més preuats dels habitants: els seus fills i els seus formatges.
Una nit, es troben un nadó humà orfe, i decideixen criar-lo com un més d’ells. Anys més tard, el noi pujarà a la superfície per descobrir una societat a la qual no s’adaptarà fàcilment.