Després d’una sèrie d’atacs dels Kazon a la Voyager, que la deixen força malmesa, Chakotay li demana a Jenaway que el millor serà pensar com a maquis. Li suggereix que formin aliances amb algunes faccions dels Kazon, cosa que la capitana rebutja fins que en Tuvok la convenç de que aquest acte portaria estabilitat al quadrant.
Una sèrie de vaixells són enfonsats misteriosament. Descobrirem que una nau submarina, el Nautilus, hi té molt a veure.
En Kryten inventa un triplicador de matèria que crea dues versions de l’objecte processat: una de millorada i una d’empitjorada. La Nan Roig te un problema i de sobte ens trobem amb la nau triplicada.
L’equip d’exploració enviat al planeta Gamma Trianguli VI troba un autèntic paradís. Però immediatament es donen compte de que el planeta és en realitat mortal, amb plantes que disparen dards, pedres explosives i llampecs.
En una estació planetària perduda, la tripulació del Nan Roig hi troba una doctora hologràfica. El problema és que l’estació era de recerca de malalties víriques i una infecció s’ha escampat.
L’Enterprise és enviada a investigar la destrucció del sistema Maluria i els seus quatre mil milions d’habitants. Quan arriba a les coordinades, la nau és atacada per una càpsula robot anomenada Nòmada. En Kirk s’identifica pel seu nom i Nòmada l’anomena “El Kirk” i creu que és el seu creador.
Un escamot de l’exercit nord-americà captura una serp gegantina, però l’avió en que viatgen sofreix un atemptat. Els russos se’n fan càrrec i…
La tripulació de la Voyager troba un robot desactivat vagant per l’espai. Torres treballa dia i nit per tal de tornar-lo a la vida. Després de moltes proves infructuoses, el cap d’enginyers finalment troba una font d’energia apropiada i la forma de vida artificial és activada.
Scotty s’està recuperant d’una ferida al cap que accidentalment li va causar un membre femení de la tripulació. Kirk i McCoy decideixen portar-lo a un club nocturn del planeta Argelius II.
I vet aquí que en Scotty s’enamora d’una ballarina i desapareixen junts. De mentres, Kirk i McCoy decideixen provar altres plaers que els ofereix el planeta abans de marxar.
Una dona espera l’autobús i veu a una altra dona molt semblant a ella, tractant de substituir-la a la seva dimensió.
En Kryten es desperta de sobte per a descobrir que ha tingut un accident i el seu sistema està autorecuperant-se. L’abast de la destrucció encara és desconeguda.
L’Enterprise és enviada a investigar la destrucció d’alguns sistemes planetaris. Descobreixen una nau en runes, a la deriva, la Constellation, on només hi queda un tripulant: l’almirall Matthew Decker.
Kirk i Scotty es queden a bord la Constellation mirant de reparar la nau, mentre en McCoy s’emporta en Decker a l’Enterprise.
Un tinent durant la II Guerra Mundial descobreix que te el do de saber quins dels seus companys moriran a la batalla.
Spock comença a tenir comportaments erràtics i estranys. En Kirk li demana a McCoy que li faci un exàmen mèdic i aquest conclou que es tracta d’un transtorn intern que pot arribar a ser mortal.
Spock els explica que els vulcanians es casen quan són nens amb el benentès que consumaran l’acte quan esdevinguin adults, i Spock ha arribat a aquest punt.
Davant la tripulació del Nan Roig es presenta l’inquisidor. Aquest és un android que cerca les persones que no han aportat res de positiu a la humanitat, i les substitueix per altres que mai no han existit.
L’Enterprise s’acosta a Pollux IV, quan un feix d’energia que surt del planeta el captura i atreu. Kirk i un equip d’exploració són teletransportats a la superfície on hi troben un èsser que afirma ser el déu Apolo, l’últim dels déus grecs que vivien a l’ancià mont Olimp. Apolo li comunica a en Kirk que tots els altres van morir d’anyorança quan van deixar la seva llar a l’Olimp.
La tripulació de la Voyager rep una transmissió d’algú que utilitza els senyals de la Federació. La capitana Janeway ordena seguir el senyal, però quan arriben a la font emissora són atacats per una nau Kazon-Nistrim que sembla conèixer com penetrar en els escuts de la Voyager. Els intrusos accedeixen a la nau estel·lar, prenen un mòdul de transport i retornen a la seva pròpia nau.
Enviats al planeta Capella IV per tal de negociar un tractat miner, Kirk i un equip d’exploració baixen a la superfície. Troben que els capellans són guerrers i amants de les tradicions. Igualment descobreixen que un agent Klingon, Kras, ha arribat abans que ells i ha establert un acord amb alguns habitants rebels que volen matar el seu líder, Akaar, i fer-se amb el control.
Un as de l’aviació durant la Gran Guerra Europea travessa un núvol i aterra a una base aèria al 1960.
La Comissionada Assistent de la Federació Nancy Hedford ha caigut malalta mentre intenta aturar una guerra a Epsilon Canaris III. La llançadora Galileu és assignada per a retornar-la a l’Enterprise, mentre ella rebi tractament per la malaltia fatal d’en Sakuro.
Kes i el Doctor noten un peculiar canvi en la percepció del Guardià, l’alienígena que va deixar la Voyager en el Quadrant Delta. Sembla que està responent a una inusual font d’energia. Recordant que el Guardià va mencionar una femella de la seva espècie, Janeway teoritza si no podria trobar-se a prop. Si fos així, una trobada amb ella podria ser un bitllet de retorn a casa. Com a precaució, en Tuvok desenvolupa una toxina que debilitaria la forma de vida femenina en cas de que es convertís en una amenaça.
Seguint el rastre energètic, la tripulació arriba a una estació espacial habitada per Ocampa, que disparen a la nau.
La pel·lícula és una seqüela del film de culte de Paul Verhoeven “Starship Troopers”. En aquesta ocasió, l’exèrcit de la Federació torna a enfrontar-se amb les tropes dels insectes, que esperen la lluita amb una nova estratègia: uns insectes molt petits s’introdueixen al cos dels humans per controlar-los el cervell. La nova batalla posa en perill la supervivència del gènere humà a l’univers.
Rimmer és teletransportat a una holonau, on hi viatja el bo i millor de les tripulacions espaials. No només hi tenen una presència física, sino que a més el reglament de la nau és clar: cal que els membres de la tripulació tinguin se*e un parell de cops al dia.
Un grup de segrestadors fortament armats, pugen a bord d’un luxós creuer a l’Oceà Pacífic Sud amb l’intenció de saquejar-lo. Però es troben amb un seguit d’animals de grans dimensions, devoradors d’homes amb tentacles, que s’han apoderat del vaixell.
Chakotay descobreix uns sorprenents símbols en un satel·lit alienígena, molt semblants a d’altres que va observar quan era un nen, en un bosc de Centreamèrica. Intrigat, demana permís per a fer-hi una exploració.
Al planeta Pyris VII, dos èssers coneguts com a Korob i Sylvia han estat enviats pel seu planeta nadiu en missió de conquesta. Utilitzant la transmutació de la matèria, assumeixen formes humanes per tal de donar la benvinguda a l’Enterprise.
Kirk, Spock i McCoy baixen per a trobar-se Scotty i Sulu convertits en zombies sense personalitat.
El Doctor ordena a Janeway un repós a l’holocoberta, però aquest es veu interromput per un primer contacte amb els Botha. El problema comença quan la capitana veu personatges de la seva novel·la deambulant per la nau
Desprès de guanyar un viatge a Las Vegas, un home s’obsessiona amb una màquina escurabutxaques.
L’Enterprise rep un misteriós senyal de socors d’un vell planeta, suposadament mort de fa molt de temps. La tripulació rep una ordre telepàtica d’algú anomenat Sargon per a que baixin a la superfície.
En un univers gairebé idèntic al nostre, existeix un altre Arnold Rimmer. Aquest és encantador, popular, valent i modest. Després de superar la velocitat de la realitat en un vol de prova, es troba cara a cara amb el seu homòleg a bord del Nan Roig.